Zotero je odnedavno postao samostalni program! Međutim i dalje nije kompatibilan s IE, već se reference i dokumenti mogu spremati samo iz Firefox, Google Chrome i Safari preglednika. Od novosti koje Zotero nudi je dugo očekivana mogućnost spajanja duplih referenci - merge files. Naravno, pojavile su se i raznovrsne aplikacije za mobilne uređaje.