Knjižnica posjeduje građu iz arheologije, povijesti i povijesti umjetnosti - 50.000 svezaka među kojima je 8 inkunabula i oko 170 knjiga iz 16. st., zbirka plakata, grafička zbirka i zbirka umjetnina.

Knjižnični fond čini oko 45 000 svezaka. Knjižnica je otvorena za javnost.

 Knjižni fundus Knjižnice Muzeja sastoji se od 32 000 svezaka. Većinu čine svesci 622 naslova periodičnih publikacija.

Knjižnica okuplja građu iz etnologije i etnografije, a otvorena je i za vanjske korisnike

Knjižnični fond od preko tri tisuće jedinica čine knjige, periodika, katalozi, preslici radova i separati vezani uz arheologiju, povijest umjetnosti, povijest, etnologiju te ostale srodne znanstvene discipline.

Knjižnica posjeduje zbirku starih knjiga (oko 15.000 naslova, od 16. do prve polovice 20. stoljeća) te priručnu stručnu knjižnicu

Knjižnicu sačinjavaju tri odjelske knjižnice: knjižnica Zoološkog i Botaničkog odjela, knjižnica Geološko-paleontološkog odjela, te knjižnica Mineraloško-petrografskog odjela. Knjižnica je otvorenog tipa.

Knjižnični fond tematski je usmjeren na srednji vijek, broji oko 6000 knjiga.

Jedna od najvećih zbirki građe iz područja moderne i suvremene umjetnosti u Hrvatskoj.

Jedna je od najstarijih specijalnih knjižnica za umjetnost i umjetnički obrt u Europi, fond od oko 60 000 svezaka

MDC je svojim zbirkama i građom te uslugama otvoren stručnoj muzejskoj zajednici, postdplomantima, studentima, učenicima, istraživačima i znanstvenicima, novinarima, kolekcionarima, ljubiteljima i proučavateljima umjetnosti, arheologije, etnologije, numizmatike i drugih muzeologiji srodnih znanosti te svim drugim zainteresiranim korisnicima.

Knjižnica posjeduje zbirku od oko 10.000 knjiga iz područja povijesti umjetnosti, kulturne povijesti, arheologije, etnologije), oko 400 naslova periodike