Ciljevi projekta EJOL bili su:
- izgradnja baze koja će preko jedinstvenog Web sučelja korisnicima osigurati pristup brojnim elektroničkim znanstvenim časopisima dostupnim preko Web-a. Prikupljanjem elektroničkih časopisa u bazu korisnici na jednom mjestu mogu pronaći i koristiti cjeloviti tekst radova velikog broja besplatno dostupnih časopisa koji su zbog raspršenosti nepoznati većem broju korisnika;
- katalogizacija svih elektroničkih naslova iz pojedinih znanstvenih područja koji tako postaju integralni dio knjižničnih fondova;
- promocija hrvatskih elektroničkih časopisa koji su uglavnom nepoznati međunarodnoj znanstvenoj zajednici i ne nalaze se u drugim sličnim bazama;
- pružanje slobodnog pristupa članovima Hrvatske istraživačke i znanstvene zajednice kao i široj svjetskoj javnosti;
- poticanje na uporabu digitalnih publikacija pri znanstveno-istraživačkom radu i obrazovanju;
- razvoj novih usluga sukladno razvoju elektroničkih izvora i potrebama korisnika;
- upoznavanje širokog kruga korisnika sa suvremenim trendovima u elektroničkom izdavaštvu.