Broj poznatih vrsta u Hrvatskoj je oko 37.000, a pretpostavljena je brojka znatno veća – od 50.000 do više od 100.000. Unatoč visokoj vrijednosti prirode u Hrvatskoj mnoge vrste su izrazito ugrožene. Crveni popis ugroženih vrsta među analiziranim biljnim i životinjskim skupinama navodi 1131 ugroženu svojtu